El proyecto modifica la estructura administrativa del departamento, argumentó el Ejecutivo al devolver al Congreso la iniciativa de ley que busca transformar a la Universidad de La Guajira en ente autónomo del orden nacional. El Gobierno basa sus motivaciones en razones de inconstitucionalidad e inconveniencia. Por ejemplo, también indica que, en virtud del artículo 150 de la Constitución Política, la competencia del legislador para determinar la estructura orgánica de las entidades públicas se restringe materialmente a la administración nacional, lo cual supone que dicha atribución no es predicable en ningún caso de la administración territorial. Dentro de la razones de inconveniencia, la objeción presidencial hace referencia a la violación del criterio de sostenibilidad fiscal y de la Ley Orgánica 819 del 2003.