A través de la Resolución 004 del 2021, la Auditoría General de la República adoptó el procedimiento, la metodología y los parámetros para la certificación anual de gestión y las evaluaciones parciales trimestrales de las contralorías territoriales y se deroga la Resolución Orgánica 015 del 2020. Con la Resolución 005 del 2021, la Auditoría establece el método para valorar los efectos del covid-19 en la certificación anual de gestión de las contralorías territoriales. Por último, con la Resolución 006 del 2021, la entidad definió el puntaje crí­tico de corte para la certificación anual de la gestión de las contralorías territoriales para la vigencia 2021.