Mediante el Decreto 1249, el Ministerio de Salud estableció en $ 30.467’099.728 el costo de la supervisión y control realizados por la Superintendencia de Salud a las entidades vigiladas en el 2018. De igual manera, realizó la asignación porcentual para cada clase y subclase de entidad vigilada. La norma determina la asignación porcentual para cada clase y subclase de entidad, repartida entre generadores de recursos, recaudadores y prestadores de servicios. Los costos correspondientes a las entidades sujetas a control de la superintendencia que, de acuerdo con las leyes 223 de 1995, 448 de 1998 y 1797 del 2016, se encuentren exentas del gravamen serán cubiertos con recursos de la Nación, según lo establecido en el artículo 2.5.5.2.23 del Decreto 780 del 2016.