Mediante el Documento 3896, el Consejo Nacional de Política Económica y Social (Conpes) definió una metodología que deberán seguir los entes gestores para presentar su propuesta de redistribución de recursos y priorización de componentes ante el Ministerio de Transporte, entidad encargada de viabilizar dicha solicitud. Esta metodología plantea dos escenarios de recomposición que pretenden, por un lado, permitir el uso de ahorros en componentes que presenten necesidades financieras y, por otro, optimizar la inversión de los recursos de cofinanciación asignados a través de la priorización de proyectos necesarios para la puesta en marcha de los sistemas estratégicos de transporte público (SETP).