Mediante la Resolución 00467 del 2014, la Fiscalía General de la Nación adoptó su nuevo esquema orgánico, en virtud del Decreto 016 del 2014, con el que el jefe del Estado hizo uso de las facultades excepcionales concedidas por la Ley 1654 del 2013 para introducir modificaciones a la estructura operativa del organismo investigador. Entre los elementos nuevos de la estructura interna de la entidad se encuentra la creación de la Dirección nacional de seccionales y seguridad y la nueva clasificación de estas sedes locales como tipo A, B, C y D, según la cantidad de unidades bajo su jurisdicción; en la primera categoría se cuenta a Bogotá, Medellín, Cali, Boyacá y Nariño, que cuentan con cuatro sedes seccionales. Además, atendiendo lo ordenado por el Decreto 018 del 2014, el ente investigador estableció su nueva planta de personal, con más de 28.300 cargos (Resolución 00468 del 2014).