La Auditoría General de la República (AGR) realiza la certificación anual de todas las contralorías territoriales, a partir de la evaluación de indicadores de gestión que permitan medir y calificar las capacidades de estas para el cumplimiento de sus funciones. Una vez expedida la certificación, debe ser remitida al Contralor General de la República dentro de los cinco días siguientes. 

Para la segunda evaluación parcial trimestral del 2023, y en adelante, será aplicable la metodología para la certificación anual de gestión y las evaluaciones parciales trimestrales de las contralorías territoriales en su versión 4.2. Esta será comunicada por la auditora auxiliar a las contralorías territoriales y publicada en la página web de la AGR.

Cabe aclarar que las fichas técnicas de indicadores en su versión aplicable y el instructivo correspondiente serán publicadas en la página web de la entidad. Además, serán comunicadas por la auditora a las contralorías territoriales.