Un año después de entrar en vigencia la Ley 1530 del 2012, la Contraloría General de la República hizo un análisis del Sistema General de Regalías y determinó que hay graves deficiencias en su implementación, que la ejecución es demasiado baja y hay una evidente represión de recursos. Para el ente de vigilancia y control fiscal, lo primero que genera incertidumbre es el tema del fortalecimiento institucional de los entes territoriales, donde en diferentes casos se observan proyectos aprobados con graves falencias en los cierres financieros. Además, se afirma que la información técnica no tiene el suficiente detalle que permita tomar decisiones apropiadas o no coincide con la fase en la cual se aprueba el proyecto.